Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

- s -

• same_asymmetric_molecule_idxs() : occ::core::Dimer
• save() : occ::interaction::FileSystemPairEnergyStore, occ::interaction::MemoryPairEnergyStore, occ::interaction::PairEnergyStore, occ::interaction::PairEnergyStoreBase, occ::io::Cube, occ::qm::Wavefunction
• scale_by() : occ::MatTriple
• scale_factor() : occ::dft::DensityFunctional
• scale_factors() : occ::interaction::CEModelInteraction
• scaled_total() : occ::interaction::CEParameterizedModel
• SCF() : occ::qm::SCF< Procedure >
• scf_density_matrix() : occ::io::FchkReader, occ::io::OrcaJSONReader
• scf_energy() : occ::io::FchkReader, occ::io::OrcaJSONReader
• scf_kind() : occ::qm::SCF< Procedure >
• SCFMethodBase() : occ::qm::SCFMethodBase
• schwarz() : occ::qm::IntegralEngine
• seitz() : occ::crystal::SymmetryOperation
• SemiNumericalExchange() : occ::dft::cosx::SemiNumericalExchange
• set_a() : occ::crystal::UnitCell
• set_accuracy() : occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_alpha() : occ::crystal::UnitCell
• set_angular_momentum() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_antisymmetrize() : occ::cg::SolvationContribution
• set_asymmetric_molecule_idx() : occ::core::Molecule
• set_asymmetric_unit_idx() : occ::core::Molecule
• set_asymmetric_unit_symop() : occ::core::Molecule
• set_asymmetric_unit_transformation() : occ::core::Molecule
• set_atom_charge() : occ::qm::cint::IntegralEnvironment
• set_atoms() : occ::disp::D4Dispersion
• set_auxiliary_basis() : occ::qm::IntegralEngine
• set_b() : occ::crystal::UnitCell
• set_background_density() : occ::isosurface::StockholderWeightFunctor, occ::slater::StockholderWeight
• set_basename() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• set_basis() : occ::io::FchkWriter, occ::isosurface::VolumeGridFunctor
• set_basis_name() : occ::io::FchkWriter
• set_beta() : occ::crystal::UnitCell
• set_block_size() : occ::dft::DFT
• set_bonds() : occ::core::Molecule
• set_c() : occ::crystal::UnitCell
• set_cell_shift() : occ::core::Molecule
• set_charge() : occ::core::Molecule, occ::core::PointCharge, occ::disp::D4Dispersion, occ::qm::cint::impl::AtomInfo, occ::qm::SCF< Procedure >, occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_charge_multiplicity() : occ::qm::SCF< Procedure >
• set_column() : occ::io::Table
• set_common_origin() : occ::qm::cint::IntegralEnvironment
• set_conditioning_orthogonalizer() : occ::qm::SCF< Procedure >
• set_connectivity_criteria() : occ::crystal::Crystal
• set_core_matrices() : occ::qm::SCF< Procedure >
• set_crystal() : occ::io::DftbGenFormat, occ::io::GMFWriter, occ::isosurface::IsosurfaceCalculator
• set_density_fitting_basis() : occ::dft::DFT, occ::qm::HartreeFock
• set_dummy_basis() : occ::qm::IntegralEngine
• set_ecp_electrons() : occ::qm::AOBasis
• set_effective_core_potentials() : occ::qm::IntegralEngine
• set_energy_component() : occ::cg::DimerResult, occ::cg::MoleculeResult
• set_env_atom_offset() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_env_contraction_offset() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_env_coord_offset() : occ::qm::cint::impl::AtomInfo
• set_env_nuclear_charge_dist_offset() : occ::qm::cint::impl::AtomInfo
• set_env_primitive_offset() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_environment() : occ::isosurface::IsosurfaceCalculator
• set_error() : occ::core::diis::DIIS
• set_exchange_factor() : occ::dft::DensityFunctional
• set_fchk_type() : occ::io::FchkWriter
• set_filename() : occ::io::JsonWavefunctionReader
• set_format() : occ::io::JsonWavefunctionWriter
• set_frozen_electrons() : occ::qm::SCFMethodBase
• set_functional() : occ::disp::D4Dispersion
• set_gamma() : occ::crystal::UnitCell
• set_gamma_point_unit_cell_molecules() : occ::crystal::Crystal
• set_guess() : occ::core::opt::LineSearch< Function >
• set_initial_guess_from_wfn() : occ::qm::SCF< Procedure >
• set_integral_policy() : occ::qm::IntegralEngineDF
• set_integration_grid() : occ::dft::DFT, occ::dft::NonLocalCorrelationFunctional
• set_interaction_energies() : occ::core::Dimer
• set_interaction_energy() : occ::core::Dimer
• set_interaction_id() : occ::core::Dimer
• set_interpolation() : occ::isosurface::VolumeGridFunctor
• set_isovalue() : occ::isosurface::MCDeformationDensityFunctor, occ::isosurface::MCPromoleculeDensityFunctor
• set_kappa() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_kind() : occ::qm::AOBasis
• set_left() : occ::core::opt::LineSearch< Function >
• set_max_iterations() : occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_method() : occ::dft::DFT, occ::io::FchkWriter
• set_mixer_damping() : occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_model_name() : occ::interaction::CEEnergyModel
• set_molecular_orbitals() : occ::qm::Wavefunction
• set_molecule() : occ::io::DftbGenFormat, occ::io::GeometryInput, occ::isosurface::IsosurfaceCalculator
• set_molecule_charges() : occ::driver::CrystalGrowthCalculator
• set_morphology_kind() : occ::io::GMFWriter
• set_multiplicity() : occ::core::Molecule, occ::qm::SCF< Procedure >
• set_name() : occ::core::Dimer, occ::core::Molecule, occ::dft::DensityFunctional, occ::io::GMFWriter
• set_now_overhead() : occ::timing::StopWatch< count >
• set_nuclear_model() : occ::qm::cint::impl::AtomInfo
• set_num_contracted() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_num_primitives() : occ::qm::cint::impl::BasisInfo
• set_num_unpaired_electrons() : occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_options() : occ::driver::CrystalGrowthCalculator
• set_orbital_index() : occ::isosurface::ElectronDensityFunctor
• set_origin_and_side_lengths() : occ::geometry::mc::MarchingCubes
• set_parameters() : occ::dft::NonLocalCorrelationFunctional, occ::disp::D4Dispersion, occ::isosurface::IsosurfaceCalculator
• set_partial_charges() : occ::core::Molecule
• set_point_charges() : occ::qm::SCF< Procedure >
• set_position() : occ::core::Atom, occ::core::PointCharge
• set_precision() : occ::dft::DFT, occ::qm::HartreeFock, occ::qm::IntegralEngine, occ::qm::IntegralEngineDF, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• set_properties() : occ::core::Dimer
• set_property() : occ::core::Dimer
• set_pure() : occ::qm::AOBasis
• set_range_separated_omega() : occ::qm::cint::IntegralEnvironment, occ::qm::HartreeFock, occ::qm::IntegralEngine, occ::qm::IntegralEngineDF
• set_right() : occ::core::opt::LineSearch< Function >
• set_rinv_origin() : occ::qm::cint::IntegralEnvironment
• set_rinv_zeta() : occ::qm::cint::IntegralEnvironment
• set_scalar() : occ::io::FchkWriter
• set_scale_factor() : occ::dft::DensityFunctional
• set_shiftwidth() : occ::io::JsonWavefunctionWriter
• set_should_antisymmetrize() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• set_should_write_surface_files() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• set_solvation_model() : occ::xtb::XTBCalculator
• set_solvent() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >, occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_surface_potential() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel
• set_system_charge() : occ::qm::SCFMethodBase, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• set_temperature() : occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• set_title() : occ::io::FchkWriter, occ::io::GMFWriter
• set_tty() : occ::core::ProgressTracker
• set_unit_cell_idx() : occ::core::Molecule
• set_unit_cell_molecule_idx() : occ::core::Molecule
• set_unit_cell_shift() : occ::core::Molecule
• set_use_density_fitting() : occ::interaction::CEModelInteraction
• set_use_normalized_distance() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• set_use_xdm_dimer_parameters() : occ::interaction::CEModelInteraction
• set_vector() : occ::io::FchkWriter
• set_volume_grid() : occ::isosurface::IsosurfaceCalculator
• set_wavefunction() : occ::isosurface::IsosurfaceCalculator
• set_x() : occ::solvent::COSMO
• set_zero() : occ::geometry::VolumeGrid, occ::gto::GTOValues
• settings() : occ::dft::MolecularGrid
• setup() : quickhull::MeshBuilder< T >
• shear_modulus() : occ::core::ElasticTensor
• shear_modulus_angular() : occ::core::ElasticTensor
• shear_modulus_minmax() : occ::core::ElasticTensor
• Shell() : occ::qm::Shell, occ::slater::Shell
• shell_to_atom() : occ::qm::AOBasis
• shellpairs() : occ::qm::IntegralEngine
• shells() : occ::qm::AOBasis, occ::qm::IntegralEngine, occ::slater::Basis
• shells_share_origin() : occ::qm::AOBasis
• short_name() : occ::crystal::SpaceGroup
• should_antisymmetrize() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• should_write_surface_files() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• SHT() : occ::sht::SHT
• side_length() : occ::isosurface::GenericStockholderWeightFunctor< Func >, occ::isosurface::LogSumExpFunctor< Metric >, occ::isosurface::MCDeformationDensityFunctor, occ::isosurface::MCElectricPotentialFunctor, occ::isosurface::MCElectronDensityFunctor, occ::isosurface::MCPromoleculeDensityFunctor, occ::isosurface::StockholderWeightFunctor, occ::isosurface::VoidSurfaceFunctor, occ::isosurface::VolumeGridFunctor
• simplify() : occ::core::Fraction
• single_point_energy() : occ::xtb::TbliteCalculator, occ::xtb::XTBCalculator
• size() : occ::cg::SolventSurface, occ::core::graph::Graph< VertexType, EdgeType >, occ::core::Molecule, occ::crystal::AsymmetricUnit, occ::crystal::CrystalAtomRegion, occ::crystal::SiteMappingTable, occ::descriptors::Steinhardt, occ::geometry::MIndex, occ::geometry::VolumeGrid, occ::qm::AOBasis, occ::qm::Shell
• size_bytes() : occ::core::numpy::NumpyArray, tinyply::Buffer
• slab() : occ::crystal::Crystal
• slice() : occ::geometry::VolumeGrid
• smd_cds_energy() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel
• SMDCalculator() : occ::cg::SMDCalculator
• SMDSolventParameters() : occ::solvent::SMDSolventParameters
• smear_orbitals() : occ::qm::OrbitalSmearing
• solution_terms() : occ::driver::CrystalGrowthCalculator
• solvated_surface_properties() : occ::driver::CrystalGrowthCalculator
• solvated_wavefunctions() : occ::driver::CrystalGrowthCalculator
• SolvationContribution() : occ::cg::SolvationContribution
• SolvationCorrectedProcedure() : occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• solvent() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel
• SolventSurfacePartitioner() : occ::cg::SolventSurfacePartitioner
• space_group() : occ::crystal::Crystal
• SpaceGroup() : occ::crystal::SpaceGroup
• SphericalHarmonics() : occ::sht::SphericalHarmonics
• spinorbital_kind() : occ::io::FchkReader, occ::io::GaussianInputFile, occ::io::MoldenReader, occ::io::OrcaJSONReader
• SpinorbitalKindValidator() : occ::main::SpinorbitalKindValidator
• square_distance() : occ::core::Atom
• start() : occ::timing::StopWatch< count >
• start_incremental_fock() : occ::qm::SCFConvergenceSettings
• state() : occ::core::KalmanEstimator
• Steinhardt() : occ::descriptors::Steinhardt
• StockholderWeight() : occ::slater::StockholderWeight
• StockholderWeightFunctor() : occ::isosurface::StockholderWeightFunctor
• stop() : occ::timing::StopWatch< count >
• StopWatch() : occ::timing::StopWatch< count >
• StructureWriter() : occ::io::crystalgrower::StructureWriter
• subtract() : occ::core::Fraction
• supports_incremental_fock_build() : occ::dft::DFT, occ::qm::HartreeFock, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• Surface() : occ::crystal::Surface
• surface_area() : occ::isosurface::Isosurface
• surface_areas_cds() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_areas_coulomb() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_cds_energy_elements() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_charge() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::COSMO
• surface_electronic_energy_elements() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_nuclear_energy_elements() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_polarization_energy() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel
• surface_polarization_energy_elements() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_positions_cds() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_positions_coulomb() : occ::solvent::ContinuumSolvationModel, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >
• surface_properties() : occ::main::IsosurfaceConfig
• surface_type() : occ::main::IsosurfaceConfig
• SurfaceCutResult() : occ::crystal::SurfaceCutResult
• symbol() : occ::core::Element, occ::crystal::SpaceGroup, occ::qm::Shell
• symbol_to_l() : occ::qm::Shell
• symmetric_orthonormalize_molecular_orbitals() : occ::qm::Wavefunction
• symmetrically_orthonormalized() : occ::qm::MolecularOrbitals
• symmetrize() : occ::MatTriple
• symmetry_data() : occ::io::CifParser
• symmetry_number() : occ::core::MolecularPointGroup
• symmetry_operations() : occ::crystal::Crystal, occ::crystal::SpaceGroup
• symmetry_related_dimers() : occ::crystal::DimerMappingTable
• symmetry_relation() : occ::core::Dimer
• symmetry_unique_dimer() : occ::crystal::DimerMappingTable
• symmetry_unique_dimer_map() : occ::crystal::DimerMappingTable
• symmetry_unique_dimers() : occ::crystal::Crystal, occ::crystal::DimerMappingTable
• symmetry_unique_molecules() : occ::crystal::Crystal
• symmetry_valid() : occ::io::CifParser
• SymmetryDimerLabeller() : occ::crystal::SymmetryDimerLabeller
• SymmetryOperation() : occ::crystal::SymmetryOperation
• SymOp() : occ::core::SymOp
• symops() : occ::core::MolecularPointGroup
• synthesis_cplx() : occ::sht::SHT
• synthesis_real() : occ::sht::SHT
• system_charge() : occ::qm::SCFMethodBase, occ::solvent::SolvationCorrectedProcedure< Proc >